INDICATII  ale acestui domeniu clinic: sindromul de colon iritabil, sindromul de malabsorbtie, intolerante alimentare, disbioza intestinala, afectiuni inflamatorii ale intestinului, tulburari imunologice si boli intestinale autoimune.

Medicina functionala trateaza tulburarile gastrointestinale prin studierea trasaturilor individuale ale pacientului si a corelatiilor neuroendocrine prin distingerea si discernerea intre acestea. Strategiile de diagnostic folosite de medicina functionala in aceasta ramura au la baza teste deosebit de avansate care nu sunt disponibile in Italia. Tratamentul functioneaza pe baza restabilirii functiilor sistemului gastroenteric prin favorizarea schimbarilor la nivelul stilului de viata si a nutritiei prin asa-numita terapie 4R.

Acest tratament, inventat si dezvoltat de grupul de cercetare stiintifica de la Institutul de Medicina Functionala din Gig Harbor, Wa, SUA, identifica patru faze esentiale in strategia de tratare a afectiunilor sistemului gastrointestinal:

• ELIMINAREA factorilor de predispozitie: alimentele la care pacientul este alergic sau la care manifesta intoleranta, alimentele de productie industriala care contin substante chimice sintetice si/sau substante toxice precum si microorganisme patogene pentru tractul intestinal
• INLOCUIREA enzimelor digestive care eventual lipsesc (de exemplu, enzimele gastrice, intestinale, pancreatice si biliare)
• REINOCULAREA florei bacteriene eubiotice afectate de diobioza intestinala
• REPARAREA peretelui intestinal degradat cu ajutorul nutrientilor necesari refacerii si producerii de energie